VMware Horizon nutzt die vorhandene Active Directory-Infrastruktur für die Benutzer- und Administratorauthentifizierung und -verwaltung. Sie können VMware Horizon auch mit anderen Arten der Authentifizierung neben Smartcards integrieren, um Benutzer von Remote-Desktops und Remoteanwendungen zu authentifizieren, z. B. mit Lösungen zur biometrischen Authentifizierung oder mit Zwei-Faktor-Authentifizierungen wie RSA SecurID und RADIUS.