ESXi puede dar formato a los dispositivos de almacenamiento basados en SCSI como almacenes de datos de VMFS. Los almacenes de datos de VMFS actúan principalmente como repositorios de máquinas virtuales.
Es posible almacenar varias máquinas virtuales en el mismo almacén de datos de VMFS. Cada máquina virtual, encapsulada en un conjunto de archivos, ocupa un único directorio separado. En el sistema operativo dentro de la máquina virtual, VMFS preserva la semántica del sistema de archivos interno, que garantiza el comportamiento correcto de la aplicación y la integridad de los datos de las aplicaciones que se ejecutan en las máquinas virtuales.
Cuando se ejecutan varias máquinas virtuales, VMFS proporciona mecanismos de bloqueo específicos para los archivos de máquina virtual. En consecuencia, las máquinas virtuales pueden operar sin problemas en un entorno de SAN en el que varios hosts ESXi comparten un mismo almacén de datos de VMFS.
Además de las máquinas virtuales, los almacenes de datos de VMFS pueden almacenar otros archivos, como plantillas de máquina virtual e imágenes ISO.