Des mécanismes de verrouillage de fichiers sont utilisés pour restreindre l'accès aux données stockées sur un serveur à un seul utilisateur ou processus à la fois. Les mécanismes de verrouillage des deux versions de NFS ne sont pas compatibles. NFS 3 utilise le verrouillage propriétaire et NFS 4.1 utilise le verrouillage spécifié du protocole natif.

Le verrouillage NFS 3 sur ESXi n'utilise pas le protocole NLM (Network Lock Manager). VMware fournit plutôt son propre protocole de verrouillage. Les verrouillages NFS 3 sont mis en œuvre en créant des fichiers de verrouillage sur le serveur NFS. Les fichiers de verrouillage se nomment .lck-file_id..

NFS 4.1 utilise des réservations de partages comme mécanisme de verrouillage.

Comme les clients NFS 3 et NFS 4.1 n'utilisent pas le même protocole de verrouillage, vous ne pouvez pas utiliser différentes versions de NFS pour monter la même banque de données sur plusieurs hôtes. L'accès aux mêmes disques virtuels à partir de deux clients incompatibles peut provoquer un comportement incorrect et entraîner l'altération des données.